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BIOLOGÍA de 2º de BACHILLERATO
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ÍNDICE DE MODELOS MOLECULARES PDB |
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DIRECCIONES WEB CON INSTRUCCIONES DETALLADAS PARA INSTALAR EL PLUGIN PARA VER LOS MODELOS PDB |
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Antes de poder ver los modelos moleculares 3D hay que tener instalado un pequeño programa (plugin) que permite al navegador abrir adecuadamente los ficheros en formato PDB. Ver instrucciones en los siguientes enlaces. |
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Instrucciones para bajar e instalar el plugin Chime. |
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http://www.mdlchime.com Para bajarse el programa Chime. |
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Enlaces de interés sobre CHIME, su instalación, compatibilidad y los problemas de instalación que puedan darse
Si se tiene Windows XP y se ha instalado Chime 2.6 SP6 for Windows no se presentará ningún problema y sólo con registrarse, descargar el plugin e instalarlo será suficiente.Si se tienen otros sistemas operativos y navegadores, es conveniente visitar las siguientes páginas: -http://www2.uah.es/biomodel/model1/info-cfg.htm: Cómo configurar el ordenador para ver los modelos 3D en formato PDB en la páginas WEB. -http://www2.uah.es/biomodel/comun/compatib/neccsoft.htm#verify : Resolución de problemas para la instalación de CHIME en el ordenador. -http://www2.uah.es/biomodel/comun/compatib/compatib.htm : Compatibilidad entre CHIME y los diferentes navegadores (Internet Explorer y Netscape).
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BASE DE MODELOS 3D |
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http://www.uwsp.edu/chemistry/pdbs/. Enlace que contiene una gran cantidad de modelos moleculares en formato pdb. Debe tenerse en cuenta que algunos modelos -sobre todo de proteínas- son ficheros muy pesados y pueden tardar un tiempo en cargarse. |
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MODELOS 3D |
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1 Hidrocarburos y otras sustancias básicas. |
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1.1 |
cc_metano.PDB | Metano | |
1.2 |
ce_etano.PDB | Etano | |
1.3 |
cg_propano.PDB | Propano | |
1.4 |
ci_butano.PDB | Butano | |
1.5 |
ck_etileno.PDB | Etileno | |
1.6 |
cl_etanol.PDB | Etanol | |
2 Agua e iones |
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2.1 | aa_agua.PDB | Agua | |
2.2 | ad_agualiquida.PDB | Agua líquida | |
3 Glúcidos |
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3.1 |
dc_glucosa.pdb | Glucosa | |
3.2 | df_glucosa_alfa.pdb | Alfa glucosa | |
3.3 | dg_glucosa_beta.PDB | Beta glucosa | |
3.4 | dh_fructosa.PDB | Fructosa | |
3.5 |
di_galactosa.PDB | Galactosa | |
3.6 |
dj_galactosa_alfa.PDB | Alfa galactosa | |
3.7 | dl_ribosa_beta.PDB | Beta ribosa | |
3.8 | dm_sacarosa.PDB | Sacarosa | |
3.9 | dn_maltosa.PDB | Maltosa | |
3.10 | do_celobiosa.PDB | Celobiosa | |
3.11 | dp_lactosa.PDB | Lactosa | |
3.12 | dq_sucrosa.PDB | Sucrosa | |
3.13 | dr_union1_6.PDB | Unión 1-6 entre monosacáridos | |
3.14 | ds_amilosa.PDB | Amilosa (almidón) | |
3.15 | dt_amilopec.PDB | Amilopectina (almidón) | |
3.16 | dt_glycoxgen.PDB | Glucógeno | |
3.17 | du_celulosa.PDB | Celulosa | |
3.18 | dv_quitina.PDB | Quitina | |
3.19 | dx_condro4.PDB | Condroitin- 4- sulfato | |
3.20 | dy_dextrano_bact.PDB | Dextrano | |
3.21 | dz_hialuron.PDB | Ácido hialurónico. | |
3.22 | dz1_oligo_lisosomico.PDB | Oligosacárido lisosómico. | |
3.23 | dz2_oligo_membr.PDB | Oligosacárido de membrana. | |
3.24 | dz3_oligo_secrec.PDB | Oligosacárido de secreción | |
4 Lípidos |
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4.1 |
ea_laurico12l.pdb | Ácido laúrico | |
4.2 |
eb_palmitic16l.pdb | Ácido palmítico | |
4.3 |
ec_estearico18l.PDB | Ácido esteárico | |
4.4 |
eg_oleico181d.PDB | Ácido oléico | |
4.5 | eh__linoleic182d.pdb | Ácido linoléico | |
4.6 | ei_arachi204d.pdb | Ácido araquidónico | |
4.7 | ej_triglicerido.pdb | Trigicérido | |
4.8 | ek_lecitina.PDB | Fosfoglicérido. Fosfatidil colina (Lecitina ) | |
4.9 | el_cefalina.PDB | Fosfoglicérido. Fosfatidil etanolamina (cefalina). | |
4.10 | em_fosfaser.PDB | Fosfoglicérido. Fosfatidil serina. | |
4.11 | en_fosfglic.PDB | Fosfatidil glicerol. | |
4.12 | eo_cardiolp.PDB | Difosfatidil glicerol (cardiolipina) | |
4.13 | ep_fosfinos.PDB | Fosfatidil inositol | |
4.14 | eq_esfingos.PDB | Esfingosina | |
4.15 | er_esfingomielina.PDB | Esfingomielina. | |
4.16 | es_colester.pdb | Colesterol | |
5 Aminoácidos, péptidos y proteínas |
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5.1 |
g01_glycina.PDB | Glicocola | |
5.2 | g02_alanina.PDB | Alanina | |
5.3 | g03_leucina.PDB | Leucina | |
5.4 | g04_valina.PDB | Valina | |
5.5 | g05_isoleucina.PDB | Isoleucina | |
5.6 | g06_fenilalanina.PDB | Fenilalanina | |
5.7 | g07_metionina.PDB | Metionina | |
5.8 | g08_prolina.PDB | Prolina | |
5.9 | g09_triptofano.PDB | Triptófano | |
5.10 | g10_serina.PDB | Serina | |
5.11 | g11_treonina.PDB | Treonina | |
5.12 | g12_tirosina.PDB | Tirosina | |
5.13 | g13_cisteina.PDB | Cisteina | |
5.14 | g14_asparagina.PDB | Asparagina | |
5.15 | g15_histidina.PDB | Histidina | |
5.16 | g16_aspartico.PDB | Ácido Aspártico | |
5.17 | g17_arginina.PDB | Arginina | |
5.18 | g18_glutamina.PDB | Glutamina | |
5.19 | g19_glutamico.PDB | Ácido glutámico | |
5.20 | g20_lisina.PDB | Lisina | |
5.21 | ha1_insulin.PDB | Insulina | |
5.22 | ha2_oxitocin.PDB | Oxitocina | |
5.23 | ha3_glucagon.PDB | Glucagón | |
5.24 | ha4_glutation.PDB | Glutation | |
5.25 | ha5_glucocorticoide.PDB | Glucocorticoide | |
5.26 | hb_ubicuitina53.PDB | Ubicuitina | |
5.27 | hj_hemob.PDB | Hemoglobina (201 KB) | |
6 Nucleótidos y ácidos nucleicos |
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6.1 | ja_AMP.PDB | AMP | |
6.2 | jb_GMP.PDB | GMP | |
6.3 | jd_CMP.PDB | CMP | |
6.4 | jd_UMP.PDB | UMP | |
6.5 | je_TMP.PDB | TMP | |
6.6 | jf_ATP.PDB | ATP | |
6.7 | jg_GTP.PDB | GTP | |
6.8 | ji_dna.PDB | ADN | |